Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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FAM53CQ9NYF3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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FAM53CQ9NYF3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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FAM53CQ9NYF3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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FAM53CQ9NYF3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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FAM53CQ9NYF3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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