Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms