Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms