Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.3 ms