Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms