Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FANCIQ9NVI1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms