Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms