Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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