Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST12Q9NRB3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms