Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BIN3Q9NQY0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms