Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
INCENPQ9NQS7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms