Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms