Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms