Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms