Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms