Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM49AQ9H0Q0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM49AQ9H0Q0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms