Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms