Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7BQ9C0I4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7BQ9C0I4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7BQ9C0I4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms