Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms