Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms