Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALN1Q9BXU9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALN1Q9BXU9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CALN1Q9BXU9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALN1Q9BXU9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALN1Q9BXU9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CALN1Q9BXU9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALN1Q9BXU9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALN1Q9BXU9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALN1Q9BXU9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALN1Q9BXU9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms