Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DSCC1Q9BVC3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSCC1Q9BVC3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms