Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms