Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms