Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP6Q9BRS8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms