Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms