Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms