Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms