Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC4A9Q96Q91 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms