Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms