Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
YTHDC1Q96MU7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms