Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms