Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms