Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC11Q96J66 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC11Q96J66 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms