Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms