Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms