Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC3Q96F86 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms