Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms