Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKL1Q969V6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms