Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-CQ95604 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms