Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms