Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CTTNBP2Q8WZ74 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CTTNBP2Q8WZ74 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms