Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms