Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms