Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms