Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms