Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LINC00116Q8NCU8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms