Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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