Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGEF1CQ8N431 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms