Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms